Представляет собой многолетний полукустарник, стебли в нижней (приземной) части становятся жесткими и одревесневают ближе к сентябрю. В высоту ветвистое растение достигает 80 см. Разрастаясь, образует пышные заросли. Стебли голые или немного опушенные, четырехгранные. Листья расположены супротивно, ланцетные, светло-зеленого цвета.

Цвести начинает в середине июня и продолжает до сентября. Отдельные цветки невелики (7-10 мм), имеют 4 длинные тычинки, которые выдаются за края цветка и придают ему пушистый вид. Цветков в колоске много, распускаются они неодновременно, держатся по 5-7 дней каждый, и потому в целом растение остается декоративным долго. Классической считается голубая окраска цветков, но встречаются также розовая, белая и фиолетовая. В конце лета начинают поспевать семена, крупные, черного цвета. Иссоп легко размножается как семенами, так и вегетативно: черенкованием или делением куста. Иссоп лекарственный обладает рядом полезных свойств, включая антисептические и противовоспалительные. Хорошо смотрится в цветниках, розариях, в рокариях и на альпийских горках.

Предпочитает хорошее освещение, плодородные, слабощелочные, не кислые, хорошо дренированные почвы. Не переносит застоя влаги. Семена высевают в конце марта-начале апреля в ящик на глубину 0,5 см. В открытый грунт иссоп высаживают в коне мая – начале июня. Схема посадки: между рядами – 50 см, в ряду – 30 см.

Засухоустойчивое растение, легко обходится без поливов. Даже в длительную жару и засуху.

Легко обходится без подкормок, так как в природе часто растет на бедных почвах, но если весной внести в почву суперфосфат и сульфат калия, то цветение будет более обильным.